Na krążowniku pojawia się uzbrojony mężczyzna, który wyzywa Hunta na pojedynek. Wkrótce statek zostaje zaatakowany przez nieznaną siłę...

Beka i Harper nadzorują ewakuacje planety Virgil IX. Odkrywają, że na pokładzie Maru przebywa istota, która zagraża komputerom jednostki.

Man Ka-Lupe ze Wspólnoty prosi Hunta o pomoc w schwytaniu zamachowca o pseudonimie 'Trędowaty'. Twierdzi, że jest jego kolejnym celem.

W krążownik uderza olbrzymia siła; efekt eksperymentów mieszkańców planety Marduk z nową bombą Dylan chce udaremnić ich zbrodnicze plany.

Maru natyka się na olbrzymi okręt. Beka, Rommie, Tyr i Dylan stwierdzają, że to 'Bellerophont, wysłany z Ziemi przed 3 tysiącami lat.

Załoga krążownika otrzymuje rozkaz przetransportowania i zapewnienia ochrony kandydatowi na wysokie stanowisko w zreformowanej Wspólnocie.

Załoga otrzymuje sygnał SOS. Podczas akcji ratunkowej dochodzi do awarii. Lider przybyszów opowiada Dylanowi o świecie, z którego uciekli.

Kapitan Hunt jest podejrzany o morderstwo. Ktoś wrobił Hunta w zbrodnię, aby go szantażować i przejąć należący do niego artefakt.

Tyr i Beka są uwięzieni w tunelu wymiarowym. Dylan próbuje ich ratować. Niebawem Beka i Tyr zjawiają się na pokładzie 'Andromedy'.

Realizacja misji zjednoczenia dobiega końca. Na pokładzie 'Andromedy' na zostać podpisany nowy statut, umożliwiający wybór nowego władcy.

Kapitan Hunt zbiera na pokładzie 'Maru' informacje o czarnej dziurze. Dochodzi do uszkodzenia, które powoduje wiele zagadkowych zdarzeń.

Klany Nietzschean zostają zaatakowane przez rycerzy czystości genetycznej. Z pomocą uciśnionym rodom spieszy załoga 'Andromedy'...

Dylan i załoga dowiadują się, że flota statków Gwardii przebywa gdzieś w układzie Tartarusa. Mają nadzieję na informację o ich położeniu.

Ekipa Hunta ściga istotę, pożerającą planety. Niebawem zostaje przez nią pożarta również 'Andromeda'. Dylan opracowuje plan uwolnienia.

Ekipa Hunta natrafia na statek Kalderan, który stał się celem ataku Vedran z pierwszej Wspólnoty. Dylan postanawia odszukać najeźdźców.

Beka z Dylanem i Trance chcą odnaleźć Narzędzie Stworzenia. Ten, kto je posiada, zyskuje moc zmieniania wszechświata zgodnie z życzeniami.

'Andromeda' trafia na uszkodzony przez Thanów statek i udziela pomocy pasażerom. Niebawem zwłoki zabitych ożywają i atakują ekipę Hunta.

Zmarł jeden z byłych członków załogi 'Andromedy' i Valentine, wspólnie z Harperem i Huntem, wyrusza w podróż, aby odebrać spadek.

Tyr i Hunt zostają zaatakowani przez zamachowców. Tyrowi udaje się uciec i dotrzeć na 'Andromedę', jednak Dylan wciąż jest ścigany.

Wielebny Bem opuszcza 'Andromedę'. Harper pracuje nad urządzeniem, mającym usunąć larwę z jego ciała, co jest niebezpieczne dla statku.

Draganie wypowiadają wojnę członkom klanu Sabra-Jaguar i załoga 'Andromedy' zostaje wciągnięta w ten konflikt.

Po zamachu stanu na planecie młody książę zostaje uratowany przez załogę 'Andromedy'. Ekipa Hunta postanawia pomóc mu odzyskać władzę.