Agenci NCIS odkrywają, że pracującego nad tajnym projektem porucznika Marynarki zabił robot 'Otto'. Niewiele brakuje, by przez tę maszynę zginęła również Abby...

W bazie marynarki wojennej zostają znalezione spalone i zmumifikowane szczątki poszukiwanego przestępcy. Agenci NCIS rozpoczynają śledztwo wspólnie z FBI.

Zakrwawiona siostra Timothy'ego McGee puka do jego drzwi. Niebawem informatyk dowiaduje się, że koledzy z NCIS prowadzą śledztwo w sprawie zabójstwa marynarza, dobrego znajomego siostry.

Samobójstwo popełnia były oficer marynarki, a na jaw wychodzą kompromitujące fakty z jego życia. Agenci NCIS udowadniają, że nie popełnił samobójstwa i nie był winien zarzucanych mu czynów.

W wojskowym klubie country dochodzi do eksplozji, której ofiarą pada pułkownik marynarki. Agenci NCIS dochodzą do wniosku, że pułkownika zabili terroryści. Włącza się wojskowe biuro śledcze.

Zostaje zaatakowany w swoim domu oficer marynarki. Bandyci porywają mu córkę. Zespół Gibbsa rozpoczyna pracę. Agenci śledzą podejrzanego - byłego kochanka żony napadniętego oficera.

Zostaje odnalezione ciało kaprala, który nie zgłosił się na służbę w Iraku. Agenci NCIS odkrywają, że został pochowany, a potem ekshumowany. Okazuje się, że kapral miał dwie narzeczone.

Ginie oficer, który brał udział w tajnej akcji. Agenci NCIS przypadkowo zatrzymują rosyjskiego szpiega. Przeszukują jego samochód i znajdują w nim broń, z której zabito oficera.

Agenci Gibbsa otrzymują informację o odnalezieniu samochodu ze śladami krwi. Auto należy do zaginionej porucznik marynarki wojennej. Detektywi w jej mieszkaniu odkrywają kartotekę mężczyzn.

Były wojskowy ucieka z zakładu karnego. Został skazany za obrabowanie banku i zabójstwo. Gibbs powraca do pracy w NCIS. Uciekinier zmusza go i Fornella do ponownego rozpatrzenia sprawy.

Ziva musi się ukrywać, bo była świadkiem zamachu dokonanego przez agenta Mossadu. Zwraca się jednak z prośbą o pomoc nie do nowego szefa NCIS, ale do będącego na emeryturze Gibbsa.

Gibbs wciąż ma luki w pamięci. Trochę pomaga mu wizyta dawnego szefa. Tymczasem agenci dowiadują się, że terroryści planują atak na Marynarkę Wojenną USA i że Gibbs zna szczegóły ich planu.

Gibbs zostaje ranny w zamachu i powoli wraca do zdrowia. Ma czas na rozmyślania. Musi sobie teraz poradzić ze wspomnieniami, które od dawna próbował wymazać z pamięci.

Ziva jest w szoku. Umiera podejrzany, nad którym sprawowała pieczę. Jego brat nic nie wie o całym zdarzeniu. Porywa dyrektor Shepard w nadziei, że wtedy agenci zgodzą się z nim pertraktować.

Dowód przeniesiony z miejsca zbrodni powoduje skażenie laboratorium. Stan Abby jest bardzo ciężki. To ona była celem przestępcy. Agenci poznają zaskakujące fakty z przeszłości koleżanki.

Podejrzana o szpiegostwo kobieta popełnia samobójstwo. Agenci znajdują dowody, że w chwili śmierci nie była sama. Rozpoczynają poszukiwania mordercy. Chcą rozwiązać zagadkę szpiegowską.

W zamarzniętym jeziorze zostają odnalezione ciała czterech osób. Jedna z ofiar zostaje zidentyfikowana jako zaginiony żołnierz piechoty morskiej. Pozostali byli członkami miejscowego gangu.

W bazie Quantico pewien licealista bierze kolegów na zakładników. Grozi zdetonowaniem przymocowanej do ciała bomby. Gibbs pertraktuje z nastolatkiem. Podejrzewa, że chłopak nie działa sam.

Grupa nastolatków znajduje identyfikatory żołnierzy piechoty morskiej. Gibbs przypuszcza, że wpadli na trop seryjnego mordercy, który w przeszłości zabijał ofiary w parku.

Zespół Gibbsa bada okoliczności eksplozji karetki wiozącej ciało żołnierza, który zginął w wypadku. DNA osoby znalezionej w ambulansie nie jest zgodne z kodem genetycznym zmarłego.

Zespół NCIS urządza obławę na marines, którzy prowadzą sklep z częściami pochodzącymi z kradzionych samochodów. Na tylnym siedzeniu jednego z aut agenci znajdują odciętą głowę.

Zamordowano żony dwóch żołnierzy piechoty morskiej. Agenci podejrzewają, że zabójstwa miały podłoże rasowe. Muszą znaleźć sprawcę zbrodni i chronić następną potencjalną ofiarę szaleńca.

Komandor, która odpowiada za przewóz broni jądrowej, zostaje uprowadzona. Agenci próbują określić miejsce jej pobytu. Zespół Gibbsa musi jak najszybciej odnaleźć uprowadzoną.

Ziva i Tony zostali uwięzieni w kontenerze znajdującym się na terenie stoczni. Abby stara się zlokalizować agentów za pomocą sygnału w ich telefonach komórkowych.

Gibbs wciąż ma luki w pamięci. Trochę pomaga mu wizyta dawnego szefa. Tymczasem agenci dowiadują się, że terroryści planują atak na Marynarkę Wojenną USA i że Gibbs zna szczegóły ich planu.

Gibbs zostaje ranny w zamachu i powoli wraca do zdrowia. Ma czas na rozmyślania. Musi sobie teraz poradzić ze wspomnieniami, które od dawna próbował wymazać z pamięci.

Ziva jest w szoku. Umiera podejrzany, nad którym sprawowała pieczę. Jego brat nic nie wie o całym zdarzeniu. Porywa dyrektor Shepard w nadziei, że wtedy agenci zgodzą się z nim pertraktować.

Dowód przeniesiony z miejsca zbrodni powoduje skażenie laboratorium. Stan Abby jest bardzo ciężki. To ona była celem przestępcy. Agenci poznają zaskakujące fakty z przeszłości koleżanki.

Podejrzana o szpiegostwo kobieta popełnia samobójstwo. Agenci znajdują jednak dowody, że w chwili śmierci nie była sama. Detektywi rozpoczynają więc poszukiwania mordercy.

W zamarzniętym jeziorze zostają odnalezione ciała czterech osób. Jedna z ofiar zostaje zidentyfikowana jako zaginiony żołnierz piechoty morskiej. Pozostali byli członkami miejscowego gangu.

W bazie Quantico pewien licealista bierze kolegów na zakładników. Grozi zdetonowaniem przymocowanej do ciała bomby. Gibbs pertraktuje z nastolatkiem. Podejrzewa, że chłopak nie działa sam.

Grupa nastolatków znajduje identyfikatory żołnierzy piechoty morskiej. Gibbs przypuszcza, że wpadli na trop seryjnego mordercy, który w przeszłości zabijał ofiary w parku.

Zespół Gibbsa bada okoliczności eksplozji karetki wiozącej ciało żołnierza, który zginął w wypadku. DNA osoby znalezionej w ambulansie nie jest zgodne z kodem genetycznym zmarłego.

Zamordowano żony dwóch żołnierzy piechoty morskiej. Agenci podejrzewają, że zabójstwa miały podłoże rasowe. Muszą znaleźć sprawcę zbrodni i chronić następną potencjalną ofiarę szaleńca.

Komandor, która odpowiada za przewóz broni jądrowej, zostaje uprowadzona. Agenci próbują określić miejsce jej pobytu. Zespół Gibbsa musi jak najszybciej odnaleźć uprowadzoną.

Ziva i Tony siedzą uwięzieni w kontenerze znajdującym się na terenie stoczni. Odnaleźli fałszywe banknoty służące terrorystom do finansowania interesów. Abby stara się zlokalizować agentów.