Agent Gibbs z zespołem prowadzi śledztwo w sprawie zabójstwa podoficera. Informację zgłosił sprzedawca przez telefon, który w czasie rozmowy usłyszał, że popełniania jest zbrodnia.

Agenci zajmują się makabrycznymi podwójnymi morderstwami. W beczkach znaleźli pocięte dwa ciała. To prokurator i szeryf, z którymi przed 10 laty Ducky prowadził sprawę o gwałt i morderstwo.

Na dnie jeziora zostaje odnalezione ciało oficera marynarki wojennej. Zaginął on przed dwoma laty. Agentom pomaga prywatny detektyw, wynajęty przez rodzinę ofiary.

Żona oficera piechoty morskiej zabija gwałciciela. Agenci odkrywają, że prowadzi ona sekretne życie. Z treści jej e-maili wynika, że mogła nieświadomie zachęcić przestępcę do tej wizyty.

Uciekający wraz z Tonym złodziej, przykuty do niego łańcuchem, ma informacje o starożytnych zabytkach skradzionych w Iraku. Tony nie wie, że złodziej jest również groźnym mordercą.

Zespół Gibbsa prowadzi dochodzenie w sprawie śmierci dowódcy marynarki wojennej, który zginął w płomieniach po udanej operacji serca. Miał wielu wrogów. Podejrzany jest pewien marynarz.

Zadaniem agentów specjalnych jest ochrona weteranki wojny w Iraku, która jest celem ataków terrorystów. Śledztwo prowadzi agentka FBI, Lina Reyes. Gibbs chce, by dopuściła do sprawy zespół.

Na poligonie piechoty morskiej znaleziono ciało cywila. Okazuje się, że to zwłoki agenta FBI. Agent Gibbs odkrywa, że mafia od lat wyrzucała tu ciała swoich ofiar. Zaczyna się śledztwo.

Zespół prowadzi śledztwo w sprawie gwałtu i morderstwa niezidentyfikowanej kobiety w mundurze porucznika marynarki wojennej. Ducky znalazł dowód, który łączy tę sprawę z dawnym śledztwem.

Zespół Gibbsa ma odnaleźć pilotów porzuconego helikoptera. Kiedy docierają do jednego z nich, ten twierdzi, że lot w ogóle się nie odbył. Abby sądzi, że sprawa dotyczy przybyszów z kosmosu.

Zostają uprowadzone żona i 9-letnia niewidoma córka kapitana marynarki wojennej. Porywacz żąda wielkiego okupu. Kapitana więzi w biurze. Obserwuje go za pomocą kamery internetowej.

W celi, która przypomina sypialnię z lat 50., znaleziono ciało kobiety. Była ona więziona wiele miesięcy, po czym zmarła z braku powietrza. Jest to jedno z kilku podobnych morderstw.

Weteran, Ernie Yost przyjeżdża do centrali NCIS. Utrzymuje, że 60 lat temu podczas walki o Iwo Jimę zamordował swojego przyjaciela. Gibbs postanawia przeprowadzić śledztwo w tej sprawie.

Właściciela pewnej prywatnej szkoły uprowadzono sprzed jego domu.