Lisa i Charlie nadal ukrywają się z córeczką na farmie. 10-letnia Allie z czasem poznaje swoje przeznaczenie. Ujawnione zostają tajemnice skrywane od lat. Rodzina musi podjąć trudną decyzję.

Zestrzelony przez wojsko statek kosmiczny jest znów gotowy do wystartowania. Na jego pokład trafiają Allie i jej rodzice dzięki czemu mogą uciec przed Mary Crawford i doktorem Wakemanem.

Generał Beers jedzie z Allie do Dakoty, gdzie dziewczynka ma stać się przynętą do schwytania obcych. Lisa i Charlie poszukują dziecka. Wkrótce na niebie pojawiają się błyskające światła.

Charlie dowiaduje się, że jest ojcem dziewczynki, która posiada niezwykłe umiejętności. Doktor Wakeman i jego kochanka planują porwanie dziecka. Chcą zdiagnozować jej paranormalne zdolności.

Rok 1983. Obcy zaczynają się interesować Charliem i Lisą. Początkowo obiektem ich badań jest chłopiec. W 1989 roku ponownie rusza realizacja projektu doktora Erica Crawforda.

Jacob Clarke powraca po latach do rodzinnego domu, aby pożegnać się z umierającą matką. Dzieli się swoim sekretem z bratem Tomem. Eric Crawford kontynuuje śledztwo swojego ojca.

Na początku lat 70. wojskowa kariera pułkownika Owena Crawforda dobiega końca. Syn pułkownika, Sam, wyrusza na Alaskę, gdzie poznaje nowe fakty dotyczące przybyszów z innych planet.

Pułkownik Crawford robi wszystko, aby nie doszło do skreślenia misji badania UFO z prezydenckiej listy zadań. Postanawia odnaleźć Jacoba Clarke'a, w którego ciele ma znaleźć potomka obcych.

Wielokrotnie porywany przez kosmitów Russell Keysi chce ustrzec przed tym swego syna, Jessego. Trwają badania nad statkiem kosmicznym. Płk Crawford prosi o pomoc 10-letniego Jacoba.

Samolot kpt. Keysa zostaje otoczony błękitnym światłem, co ratuje go przed zestrzeleniem. Przez lata Keys cierpi potem na bóle głowy, a członkowie załogi umierają w dziwnych okolicznościach.